En botanique, un organe est dit cilié quand son bord (marge) est garni de poils fins, rigides ou souples, appelés cils (comme les cils des paupières). Ces poils marginaux sont perpendiculaires au bord et régulièrement espacés. Le terme est dérivé du latin cilium (cil, poil).
Distinction avec la pilosité
La ciliation concerne spécifiquement le bord de l'organe. Un limbe piléeux mais non cilié a des poils répartis sur les faces, pas sur le bord. Un organe peut être glabre sur les faces et cilié en marge, comme chez certains Carex (écailles ciliées) et des feuilles de Luzula (présentes des longs poils blancs en marge foliaire).
Valeur diagnostique
La présence, la longueur et la densité des cils sont des caractères utilisés pour distinguer des espèces proches. Dans les Rumex, les Carex et les mousses (notamment les Mnium), le caractère cilié/non cilié des feuilles ou bractées est souvent mentionné dans les clés d'identification. L'observation se fait à la loupe (x10) sur des organes frais.

