En botanique, l'ombilic (ou nombril) désigne avant tout le hile, cicatrice laissée sur la graine à l'endroit où elle était attachée au funicule. Par extension, le mot qualifie aussi une dépression centrale en forme de nombril, observée sur certains fruits, chapeaux de champignons ou feuilles. Il vient du latin umbilicus (nombril), dont le grec omphalos est l'équivalent.
L'ombilic de la graine, ou hile
Sur la graine, l'ombilic (ou hile) se repère comme une tache souvent colorée et allongée : c'est la trace du funicule, le petit cordon qui reliait l'ovule au placenta du fruit. Sa forme, sa taille et sa couleur aident à distinguer les légumineuses entre elles. Chez le haricot (Phaseolus vulgaris), il est petit et généralement blanc ; chez le soja (Glycine max), il est ovale et souvent coloré ; chez la fève (Vicia faba), il est étroit, long et foncé. C'est aussi près du hile que se trouve le micropyle, minuscule pore par lequel l'eau pénètre d'abord lors de la germination.
Le chapeau ombiliqué des champignons
En mycologie, un carpophore ombiliqué est un champignon dont le chapeau porte au centre un creux en forme de nombril. Ce caractère se rencontre chez des genres comme Omphalina, dont le nom dérive justement d'omphalos, Gerronema ou certains Clitocybe. Il ne faut pas le confondre avec le chapeau mamelonné, qui présente au contraire une bosse centrale.
Fruits et feuilles ombiliqués
Un fruit ombiliqué montre une dépression à son sommet, à l'opposé du pédoncule, où subsistent souvent les restes du calice ou du style. Pour les feuilles, le terme s'applique aux limbes peltés dont le pétiole s'insère au centre, creusant une petite cuvette. Le meilleur exemple est le nombril-de-Vénus (Umbilicus rupestris), plante grasse de la famille des Crassulacées qui pousse sur les vieux murs et les rochers, et dont le nom de genre reprend précisément le mot latin.
