Un pathovar (abrégé pv.) désigne, chez une même espèce de bactérie pathogène des plantes, un groupe de souches qui se distinguent par les hôtes qu'elles parviennent à infecter. Le mot est une contraction de l'anglais « pathological variety ». Une seule espèce bactérienne peut ainsi regrouper de nombreux pathovars, chacun lié à une plante ou à un groupe de plantes précis.
Comment s'écrit le nom d'un pathovar ?
Le nom suit celui de l'espèce, précédé de l'abréviation pv. : on écrit Pseudomonas syringae pv. tomato. L'épithète reprend le plus souvent le nom latin ou commun de l'hôte. Le pathovar n'est pas un rang reconnu par le Code international de nomenclature des bactéries : ses règles de dénomination relèvent des standards établis par l'International Society for Plant Pathology, qui demandent de décrire la gamme d'hôtes et une souche de référence.
Exemple : Pseudomonas syringae
Pseudomonas syringae est un exemple classique : elle comprend plus de 50 pathovars reconnus. P. syringae pv. tomato attaque spécifiquement la tomate, sur laquelle elle provoque la moucheture bactérienne, P. syringae pv. pisi attaque le pois, P. syringae pv. mors-prunorum attaque les Prunus (cerisier, prunier). Chaque pathovar a des facteurs de virulence adaptés à son hôte.
Un autre cas au potager : Xanthomonas campestris
Le genre Xanthomonas illustre aussi la notion. Xanthomonas campestris pv. campestris cause la nervation noire des choux et des autres crucifères : les feuilles jaunissent en forme de V depuis le bord et leurs nervures noircissent. D'autres pathovars de la même espèce visent des plantes différentes, d'où l'intérêt de nommer précisément l'agent en cause avant de traiter.
Pathovar, race, biovar : quelles différences ?
- Pathovar : défini par la gamme d'hôtes, c'est-à-dire les espèces végétales attaquées.
- Race : subdivision d'un pathovar selon les variétés d'un même hôte qu'elle peut infecter, souvent liée aux gènes de résistance de ces variétés.
- Biovar : défini par des caractères biochimiques ou physiologiques de la bactérie, sans lien direct avec l'hôte.
- Sérovar : défini par la réaction des souches à des anticorps.
Importance agronomique
Identifier le pathovar est essentiel pour le diagnostic phytosanitaire et pour choisir les mesures de lutte adaptées : rotation des cultures, semences saines, variétés tolérantes. Les tests de pathogénicité sur plantes hôtes (inoculations) et les méthodes moléculaires (PCR, séquençage) permettent de déterminer le pathovar. Le même pathovar peut présenter des races physiologiques, ajoutant un niveau supplémentaire de spécificité parasitaire.
Le pathovar en pratique pour le jardinier
Une bactérie de la tomate peut-elle contaminer mes choux ?
En règle générale non : un pathovar est adapté à son hôte. La bactérie de la moucheture de la tomate ne provoque pas la nervation noire des choux, qui relève d'une autre espèce. Le nettoyage des outils reste utile, car chaque culture a ses propres bactéries.
Pourquoi un même nom d'espèce revient-il pour des maladies si différentes ?
Parce que l'espèce bactérienne est large et que ce sont ses pathovars qui portent la spécialisation. Lire le nom complet, pathovar compris, sur un bulletin de santé du végétal ou une fiche de diagnostic évite de confondre deux maladies.
