Un pathovar (abrévié pv.) est une subdivision infraspécifique des bactéries phytopathogènes, définie par leur capacité à infecter un hôte particulier ou un groupe d'hôtes. Le terme est une contraction de à pathological varietyà. Un même nom d'espèce bactérienne peut inclure de nombreux pathovars, chacun spécifique à une plante ou à un groupe de plantes.
Exemple : Pseudomonas syringae
Pseudomonas syringae est un exemple classique : elle comprend plus de 50 pathovars reconnus. P. syringae pv. tomato attaque spécifiquement la tomate, P. syringae pv. pisi attaque le pois, P. syringae pv. mors-prunorum attaque les Prunus. Chaque pathovar a des facteurs de virulence adaptés à son hôte.
Importance agronomique
Identifier le pathovar est essentiel pour le diagnostic phytosanitaire et pour choisir les mesures de lutte adaptées. Les tests de pathogénicité sur plantes hôtes (inoculations) et les méthodes moléculaires (PCR, séquençage) permettent de déterminer le pathovar. Le même pathovar peut présenter des races physiologiques, ajoutant un niveau supplémentaire de spécificité parasitaire.
