Le blastocyèle (ou blastocéle) est la cavité liquide apparaissant au centre de la blastula lors de la segmentation de l'œuf. En botanique, le terme est rarement employé dans ce sens strict ; on le rencontre surtout dans les comparaisons entre développement embryonnaire végétal et animal, ou dans l'étude des embryons d'algues.
Contexte algologique
Chez certaines algues vertes comme Volvox, la formation d'une sphère creuse résulte d'un processus analogue. L'intérieur de la colonie contient un gel mucilagineux fonctionnellement comparable au blastocyèle animal. L'étude de ces structures a contribué aux théories sur l'origine des organismes multicellulaires.
Embryogénèse des angiospermes
Chez les plantes à fleurs, l'embryogénèse n'implique pas de blastocyèle au sens strict. L'œuf fécondé se divise de manière asymétrique, produisant une cellule apicale (futur embryon) et une cellule basale (suspenseur). La cavité équivalente est le sac embryonnaire, structurellement très différent d'un blastocyèle animal.

